ক্যান্টনমেন্ট কলেজ যশোরের লক্ষ্য শিক্ষার এমন একটি প্রক্রিয়ার সূচনা করা, যার মাধ্যমে প্রত্যেক শিক্ষার্থী তার মনের চোখকে জ্ঞানের আলোর দিকে ফেরাতে পারে। এছাড়া প্রত্যেক শিক্ষার্থীকে জ্ঞানান্বেষণের পুরোহিত ও জ্ঞান-সমৃদ্ধ চিন্তশীলতার জীবন্ত রূপায়ণ হিসেবে তৈরি করাও এ শিক্ষা প্রতিষ্ঠানের অন্যতম লক্ষ্য ও উদ্দেশ্য। শিক্ষার অনুকূল পরিবেশ সৃষ্টি করে নিষ্ঠা সহকারে জ্ঞানার্জনে ছাত্র-ছাত্রীদের ব্রতী করে তোলাই এই কলেজের নিরন্তর প্রয়াস। জ্ঞানার্জনের পাশাপাশি নানা ধরনের সহশিক্ষা সহায়ক কার্যক্রম, নিয়মিত খেলাধুলা, সাংস্কৃতিক চর্চা, নৈতিকতার বিকাশ ঘটিয়ে সুনাগরিক সৃষ্টি ও ভবিষ্যতের জন্য শিক্ষার্থীদের প্রস্তুত করা প্রতিষ্ঠানের উদ্দেশ্য।